בנם של כרמלה ונסים. תומר נולד בבאר שבע ביום ה' באדר ב' תשל"ג (9.3.1973). ילד שני להוריו, אח של מוטי ודורון.

ב-27.10.1991 התגייס תומר לצה"ל. הוא שירת בחיל חימוש ומשסיים את שירות החובה המשיך לשירות קבע בחיל.

תומר נשא לאישה את שרון. בני הזוג גרו במושב גילת בדרום, שם גידלו את ארבעת ילדיהם: שגיב נולד ב-1997, נתנאל ב-2002, התאומות שירז ותאיר ב-2006.

רב-סמל בכיר תומר נפל בעת מילוי תפקידו ביום כ"ז בתמוז תשע"ו (2.8.2016). בן ארבעים ושלוש בנפלו. הוא הובא למנוחות בבית העלמין הצבאי בבאר שבע. הותיר אישה וארבעה ילדים, הורים ושני אחים.